ວັດວິຊຸນສ້າງຂຶ້ນເມື່ອຄ.ສ 1503 ຕາມຄໍາສັ່ງຂອງພະເຈົ້າຊີວິດວິຊຸນນະລາດ ແລະ ໄດ້ຕັ້ງຊື່ວັດຕາມພະນາມຂອງພະອົງເອງ ໜັງສືພົງສາວະດານກ່າວວ່າ ວັດວິຊຸນສ້າງສຳເລັດເມື່ອປີ ຄ.ສ 1504 ເມື່ອສ້າງສໍາເລັດແລ້ວ ກໍ່ໄດ້ອັນເຊີນພະບາງຈາກວັດມະໂນລົມມາປະທັບໄວ້ວັດວິຊຸນນີ້.
ວັດວິຊຸນ ທີ່ສຳຄັນກໍ່ເພາະມີພະເຈດີພະປະທຸມ (ພະທາດດອກບົວໃຫຍ່) ເປັນທາດໃຫຍ່ຈົບງາມກ່ວາໝູ່ໃນສະໄໝນັ້ນ ແລະ ໃນສະໄໝຕໍ່ມາຄົນທັງຫຼາຍເອີ້ນວ່າ ພະທາດໝາກໂມ ເພາະມີຮູບຄ້າຍໆຄືໝາກໂມຕັດເຄິ່ງ ພະເຈດີປະທຸມນີ້ໄດ້ຊຸດໂຊມ ແລະ ປະຖິ້ມໄລຍະໜຶ່ງ ສະໄໝໂຈນຫໍ້ປຸ້ນຊັບສົມບັດຂຸດຄົ້ນວັດວາອາຮາມ ປູຊະນີຍະສະຖານຕ່າງໆ. ເມື່ອມາເຖິງ ຄ.ສ 1895 ສະໄໝປົກຄອງຂອງເຈົ້າຊີວິດ ສັກກະຣິນ ໄດ້ດຳເນີນການສ້ອມແປງໃໝ່ ແລະ ມາເຖິງປີ ຄ.ສ 1914 ພະເຈດີປະທຸມກໍ່ໄດ້ໂຍດລົງບາງບ່ອນຈຶ່ງໄດ້ດຳເນີນການສ້ອມແປງອີກເປັນຄັ້ງທີສອງ ໃນການສ້ອມແປງຄັ້ງທີສອງນີ້ ເພິ່ນໄດ້ພົບວັດຖຸມີຄ່າຈຳນວນຫຼາຍເຊັ່ນ: ພະທາດເຈດີຄຳຈຳລອງແບບ, ພະພຸດທະຮູບຄຳ, ເງິນ, ທອງ ແລະ ອື່ນໆ ເຊິ່ງເປັນວັດຖຸທີ່ມີຄຸນຄ່າທາງປະຫວັດສາດ ແລະ ສິລະປະວັດທະນະ ທຳສະຕະວັດທີ 15 ແລະ 16. ບັນດາວັດຖຸ ທີ່ມີຄ່າທັງໝົດທີ່ກ່າວນັ້ນເພິ່ນໄດ້ເອົາໄປເກັບຮັກສາໄວ້ຢູ່ພິພິທະພັນຣາຊະວັງເກົ່າເຈົ້າຊີວິດ (ປະຈຸບັນແມ່ນຫໍພິພິທະພັນພະຣາຊະວັງເກົ່າຫຼວງພະບາງ).